SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

Becerra V.,Viviana; Paredes C.,Mario.

En las últimas décadas ha habido un notorio aumento en los marcadores genéticos disponibles para estudios de diversidad genética. Algunos de ellos tienen diferentes bases moleculares, pero todos están enfocados a determinar la organización de la estructura genética en las poblaciones naturales y cultivadas. Además, ellos muestran la similitud entre y dentro de las poblaciones evitando el efecto ambiental. Conocer la similitud entre los individuos y las poblaciones es de gran utilidad en los programas de mejoramiento genético, pues permite, además de la organización del material la selección adecuada de los genotipos superiores y la complementación con datos fenotípicos y agronómicos para el desarrollo de una población mejorada. Este artículo revisa algunos...

Tipo: Journal article

Palavras-chave: Biotecnología; Diversidad genética; Polimorfismo.

Ano: 2000

URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072000000300007

DIVERSIDAD BIOQUÍMICA Y MOLECULAR EN FRUTILLAS CHILENAS (Fragaria chiloensis L. Duch.) Y SU IMPLICANCIA EN EL MEJORAMIENTO GENÉTICO DE LA ESPECIE

Becerra V.,Viviana; Paredes C.,Mario; Romero O.,Agnes; Lavín A.,Arturo.

La frutilla chilena (Fragaria chiloensis L. Duch.) es una especie nativa de Chile que fue domesticada antes de la llegada de los españoles. Esta especie es uno de los progenitores de la frutilla cultivada (F. x ananassa) y se encuentra distribuida en una amplia zona del país, colonizando diferentes sistemas agroecológicos. Aparentemente, en estos diversos hábitats se han desarrollado diferentes ecotipos que presentan una gran diversidad de características morfológicas y agronómicas. Los objetivos del trabajo fueron: a) determinar la diversidad genética de una muestra representativa de frutillas chilenas usando marcadores bioquímicos y moleculares; b) comparar la información previamente generada por la amplificación de ADN polimórfico al azar (RAPD) en las...

Tipo: Journal article

Palavras-chave: Isoenzima; Marcador AFLP; Diversidad genética.

Ano: 2001

URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072001000400003

COMPARACIÓN ENTRE ANÁLISIS MORFOLÓGICOS Y DE ADN PARA LA IDENTIFICACIÓN DE ESPECIES DE Fusarium AISLADOS DE MELÓN (Cucumis melo L.)

Riveros B.,Fernando; Muñoz,Gastón; González,Lucas; Rojas P.,Leonardo; Alvarez A.,Mario; Hinrichsen R.,Patricio.

Se evaluó la diversidad de especies de Fusarium asociadas con la marchitez del melón (Cucumis melo L.) mediante RAPD, comparándose tales resultados con la identificación taxonómica en base a caracteres morfológicos y patogénicos. Se estudiaron 18 aislamientos colectados de cultivos comerciales de melón establecidos entre la III y IV Región, Chile. Las observaciones morfológicas determinaron que once aislamientos correspondían a F. oxysporum, cuatro a F. semitectum, uno a F. solani y uno a F. subglutinans. Aislamientos identificados como F. oxysporum produjeron síntomas de marchitez solamente en plantas de melón, identificándolos, por lo tanto, como F. oxysporum f. sp. melonis (Fom). Los perfiles de ADN obtenidos mediante RAPD así como los análisis de...

Tipo: Journal article

Palavras-chave: RAPD; Diversidad genética.

Ano: 2001

URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072001000300004

Variación morfológica de tres especies de curubas (Passiflora tripartita var. mollissima, P. tarminiana y P. mixta) y sus híbridos en el Valle del Cauca (Colombia)

Rev. Bras. Frutic.

Primot,Sophie; d'Eeckenbrugge,Geo Coppens; Rioux,Vincent; Pérez,John Albeiro Ocampo; Garcin,François.

Se estudió la variación morfológica entre ocho accesiones de las tres principales especies de curubas cultivadas y silvestres del Valle del Cauca, Passiflora tripartita var. mollissima (curuba de Castilla), Passiflora tarminiana (curuba india) y Passiflora mixta (curuba de monte) y 11 de sus híbridos, usando el análisis de componentes principales y el método de clasificación del vecino más próximo en 105 caracteres cualitativos y cuantitativos. Siete componentes principales explican 84% de la varianza total. Las clasificaciones sobre los caracteres cualitativos y cuantitativos muestran una clara agrupación por especie. Dentro de P. mixta, se distinguen un tipo poco pubescente, representativo de las plantas silvestres más comunes, y un tipo muy pubescente,...

Identificación de Cultivares y Líneas de Mejoramiento de Arroz de Chile Mediante Amplificación de Fragmentos Polimórficos (AFLP)

Palavras-chave: Caracterización morfológica; Diversidad genética; Premejoramiento; Antracnosis.

Ano: 2005

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452005000300030

Aguirre,Carlos; Alvarado,Roberto; Hinrichsen,Patricio.

Doce cultivares y líneas de arroz (Oryza sativa L.) desarrollados por el programa de fitomejoramiento del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), Centro Regional de Investigación Quilamapu, fueron caracterizados genéticamente mediante amplificación de fragmentos polimórficos (AFLP). De 21 combinaciones ensayadas, sólo 16 fueron informativas, generando un total de 667 amplicones, 94 de ellos polimórficos (14,4%), con un rango entre 9 y 33% de polimorfismo por combinación. Esto indica que el material manejado por el programa de INIA presenta un bajo nivel de diversidad genética comparado tanto con germoplasma silvestre de la especie como con aquel usado por otros programas de fitomejoramiento de la especie. Los amplicones polimórficos detectados...

Tipo: Journal article

Palavras-chave: Diversidad genética; Fingerprinting; AFLP; Pedigrí; Cultivares chilenos de arroz.

Ano: 2005

URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072005000400002

Análisis de diversidad genética en tres poblaciones de llamas (Lama glama) del noroeste argentino

RChHN

BUSTAMANTE,ANA V; MATÉ,MARÍA L; LAMAS,HUGO E; GIOVAMBATTISTA,GUILLERMO; ZAMBELLI,ANDRÉS; VIDAL-RIOJA,LIDIA.

Este trabajo describe la variabilidad genética actual de tres poblaciones de llamas (Lama glama) del noroeste argentino (NOA), afectadas a la producción de fibra. Originariamente, las tropas fueron una única población la cual fue subdividida hace 10 años. Se estudiaron muestras de ADN de 77 animales mediante amplificación por PCR de 12 loci microsatélite con cebadores específicos de llama. La alta variabilidad genética comprobada se sustenta en el hallazgo total de 140 alelos diferentes, 9 a 16 alelos por locus y rangos de heterocigosidad observada y esperada por locus de 1 a 0 y 0,9 a 0,47, respectivamente. Diecinueve de treinta y seis pruebas de equilibrio de Hardy-Weinberg mostraron desvíos significativos (P < 0,05) debidos a una deficiencia de...

Tipo: Journal article

Palavras-chave: Camélidos sudamericanos; Diversidad genética; Estructura poblacional; Marcadores microsatélite; Manejo.

Ano: 2006

URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-078X2006000200004

Diversidad de maíz potencial agronómico y perspectivas para su conservación y desarrollo in situ, en el sureste del estado de México

González González, Miguel.

Para diseñar estrategias de conservación in situ de la diversidad genética del maíz, se requiere de valorar tanto a la diversidad como al potencial para incrementar la producción bajo el esquema de la agricultura tradicional como punto de referencia. Dado que el intercambio de semilla se da principalmente dentro de las comunidades rurales, se consideró al municipio de Ayapango, Edo. de Méx., para colectar las poblaciones de maíz que se manejan en aproximadamente el 20% de los hogares. Se colectaron 97 poblaciones de la raza Chalqueño, y dos de Cacahuacintle. Dentro de Chalqueño hubo poblaciones del tipo de grano cremoso (49), del conocido localmente como Palomo (19), del azul (24), del rojo (4) denominado localmente como “xitocle”, y una población de...

Tipo: Tesis

Palavras-chave: Diversidad genética; Maíz; Chalqueño; Conservación in situ; Isoenzimas; Doctorado; Genética; Genetic diversity; Maize; Chalqueño; In situ conservation; Isozymes.

Ano: 2007

URL: http://hdl.handle.net/10521/1585

Diversidad genética y patrón de cruzamiento en poblaciones naturales de Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco

EFECTOS DE LA CONTAMINACION SOBRE LA DIVERSIDAD GENETICA DE MAZZAELLA LAMINARIOIDES (BORY) FREDERICQ (GIGARTINALES, RHODOPHYTA) EN BAHIAS

Cruz Nicolas, Jorge.

Se determinó la estructura de la diversidad genética y el patrón de cruzamiento en poblaciones naturales de Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco en México con base en información de isoenzimas. Para evaluar la diversidad genética se utilizó una muestra de 11 poblaciones naturales distribuidas en diferentes regiones geográficas (noroeste, noreste y centro) del país; el patrón de cruzamiento y su efecto sobre el nivel de endogamia sólo se evaluó en una muestra de tres poblaciones, representativas de cada región geográfica. Se encontró una amplia diversidad genética a nivel de especie (83.3% de loci polimórficos y un promedio de 2.9 alelos por locus), pero reducida a nivel de poblaciones (28.3 % de loci polimórficos y 1.52 alelos por locus), especialmente en...

Tipo: Tesis

Palavras-chave: Abeto Douglas; Distancias genéticas; Diversidad genética; Endogamia; Isoenzimas; Polimorfismo; Polinización cruzada; Maestría; Genética; Cross-pollination; Douglas-fir; Genetic distances; Genetic diversity; Inbreeding; Isozymes; Polymorphism.

Ano: 2007

URL: http://hdl.handle.net/10521/1587

Gayana Botánica

Palma,Mario; González,Fidelina; Romo,Héctor; Ruiz,Eduardo; Fuentealba,Carmen.

Se determinó y comparó la variabilidad genética interpoblacional de Mazzaella laminaroides (Bory) Fredericq presente en Bahía Coliumo, Bahía San Vicente y Bahía Concepción, las que presentan diversos grados de contaminación. La variabilidad fue evaluada sobre la base del polimorfismo en un locus de la enzima super-óxido dismutasa en 50 ejemplares gametofitos de poblaciones de M. laminarioides en cada una de las bahías. Los sectores muestreados fueron 1) cercano al Puerto de la Segunda Zona Naval en Bahía Concepción (Talcahuano), 2) Caleta Lenga en Bahía San Vicente y 3) Dichato en Bahía Coliumo. El locus sod-1 mostró dos alelos (A y B). De los sectores estudiados, la mayor frecuencia para el alelo B se encontró en la población de Bahía Concepción con...

Tipo: Journal article

Palavras-chave: Sod-1; Mazzaella laminarioides; Diversidad genética; Contaminación.

Ano: 2007

URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-66432007000100003

RAPD e ITS Detectan Variación Molecular en Poblaciones Chilenea de Beauveria bassiana

Variabilidad genética del mildiu (Bremia lactucae Regel) en Salamanca y San Miguel de Allende, Guanajuato, mediante RAPD e ISSR

Becerra V,Viviana; Paredes C,Mario; Rojo M,Carmen; France I,Andrés.

Los hongos entomopatógenos son una alternativa atractiva para el control biológico de insectos plagas. En Chile, el Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), Centro Regional de Investigación Quilamapu mantiene aproximadamente 400 aislamientos de Beauveria, colectados a través del país. Esta colección ha sido parcialmente clasificada en base a su morfología y a su eficacia como controlador biológico. Sin embargo, es necesario complementar estos estudios con una caracterización a nivel genético-molecular, para determinar el nivel de diversidad genética de Beauveria bassiana e identificar posibles patrones de bandas que permitan dicriminar entre aislamientos. En este estudio, se analizaron 36 aislamientos de B. bassiana provenientes de diversas...

Tipo: Journal article

Palavras-chave: Hongos entomopatógenos; Diversidad genética; RAPD; Espaciadores internos transcritos (ITS).

Ano: 2007

URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072007000200001

Martínez Martínez, Susana.

Bremia lactucae Regel causa una de las enfermedades de mayor importancia en la lechuga a nivel mundial. Debido a que este pseudohongo presenta dos tipos de reproducción: sexual y asexual, su diversidad genética es amplia y puede dar origen a nuevas razas. Dicha situación se desconoce en México, por lo que es importante conocer este aspecto en las zonas productoras de esta hortaliza, así como también la influencia que ejercen los factores ambientales sobre la incidencia y severidad del patógeno. Por ello, fueron determinadas la incidencia y severidad de B. lactucae en 15 variedades de lechuga, además se registraron variables ambientales como la temperatura, humedad relativa, humedad de la hoja y precipitación en los municipios de Salamanca y San Miguel de...

Tipo: Tesis

Palavras-chave: Bremia lactucae; Mildiu; Diversidad genética; Microsatélites; Maestría; Fitopatología; Mildew; Genetic diversity; Microsatellite.

Ano: 2008

URL: http://hdl.handle.net/10521/1675

Diversidad genética y potencial de poblaciones criollas de maíz del centro - sur de Tamaulipas, México

Pecina Martínez, José Agapito.

Se ha demostrado el potencial que tienen las poblaciones criollas de maíz de Tamaulipas; sin embargo, éstas no se han aprovechado eficientemente, debido al escaso trabajo de investigación, especialmente en mejoramiento genético realizado en el Estado. Por lo tanto, es necesario preservar y explorar aún más la diversidad genética y seguir generando conocimiento que permita definir estrategias y acciones para evitar su erosión y su posible contaminación con maíces transgénicos que se introduzcan al país. Con base en lo anterior, desde el 2001, en la Unidad Académica Multidisciplinaria de Agronomía y Ciencias de la Universidad Autónoma de Tamaulipas se implementó un programa de rescate, conservación y manejo de germoplasma criollo de maíz. De más de...

Tipo: Tesis

Palavras-chave: Maíz criollo de Tamaulipas; Diversidad genética; Aprovechamiento de la diversidad; Mejoramiento de maíz; Indicadores de respuesta ambiental.; Landraces of maize from Tamaulipas; Genetic diversity; Use of the diversity; Maize breeding; Environmental response indicators.

Ano: 2008

URL: http://hdl.handle.net/10521/1192

EMERGENCIA DE BEGOMOVIRUS EN CUBA

Rev. Protección Veg.

Martínez,Yamila.

Los begomovirus son patógenos de plantas que en las últimas décadas han causado importantes pérdidas a cultivos de interés económico, en regiones tropicales y subtropicales. En Cuba se han identificado nueve begomovirus afectando cultivos de importancia económica como tomate, fríjol, tabaco, pimiento, calabaza, papa, y malezas de diferentes familias botánicas. En este trabajo se analizaron las secuencias de la región intergénica (RI) y la región N- Terminal de la proteína asociada a la replicación (Rep) de los diferentes begomovirus identificados en Cuba, referidas en el banco de datos de genes (Genebank), utilizando programas estadísticos para los alineamientos, análisis filogenéticos y búsqueda de recombinaciones. La detección de posibles eventos de...

Tipo: Journal article

Palavras-chave: Begomovirus; Recombinaciones; Diversidad genética; TYLCV; Evolución.

Ano: 2008

URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522008000100002

Variabilidad genética de Hartón del Valle mediante RAM

Piedrahíta,Ana M; Posso,Andrés; Muñoz,Jaime E; Álvarez,Luz A.

El Hartón del Valle (HV) hace parte de las siete razas criollas de ganado bovino colombiano y de acuerdo con los criterios de la FAO está considerado como vulnerable. Para estudiar su variabilidad genética fueron muestreados 33 individuos HV y tres animales de la raza Holstein, como control externo. Se extrajo ADN utilizando el método de Salting Out y las muestras fueron analizadas mediante la técnica molecular RAM (Randon amplified microsatellites). Se utilizaron los cebadores CGA, CCA, TG, y CT. El valor promedio de heterocigosidad esperada fue de 0.26 y el F ST fue 0.39 ± 0.03. Con el índice de Dice-Nei Li y agrupando con el método UPGMA se distinguieron dos grupos: uno integrado por dos hatos de conservación y el otro por cuatro fincas que han...

URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122008000100011

Palavras-chave: Diversidad genética; Bovinos criollos; Microsatélites; Hartón del Valle; RAM.

Ano: 2008

Caracterización molecular de 15 aislamientos de Beauveria bassiana asociados con Cosmopolites y Metamasius en plátano y banano en tres regiones de Colombia

Marmolejo,Diego Fernando; Mejía,Rosa; Hurtado Tenorio,Ifigenia; Posso Terranova,Andrés Mauricio; Muñoz Flórez,Jaime Eduardo.

Se colectaron picudos de Cosmopolites y Metamasius en municipios del Valle del Cauca, Caldas y Quindío. Se obtuvieron cultivos monospóricos con diluciones de 10-10 y 10-11. Los aislamientos fueron almacenados a -80°C con glicerol al 10% y el ADN a -20°C. Los marcadores moleculares RAM generaron 82 fragmentos de los cuales 67% fueron polimórficos con una heterocigocidad de 0.24, que indica diversidad media a alta. A un índice de similitud 0.84 se formaron 5 grupos: uno con 11 aislamientos y 4 con un solo aislamiento. En el gran grupo se detectó un duplicado y se encontró diversidad del hongo en los sitios muestreados. No se encontró relación entre aislamientos sobre Cosmopolites y Metamasius o zona geográfica en la formación de grupos genéticos.

URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122008000300008

Palavras-chave: Entomopatógenos; Deuteromicetes; Marcadores moleculares; RAM; Diversidad genética; Picudos; Coleoptera Rhinchophorinae; Musa spp.

Ano: 2008

Establecimiento de una colección de trabajo de uchuva del suroccidente colombiano

Bonilla Betancourt,Martha Liliana; Espinosa Piedrahíta,Katherine; Posso Terranova,Andrés Mauricio; Vásquez Amariles,Herney Darío; Muñoz Flórez,Jaime Eduardo.

Physalis peruviana L. es una especie frutícola promisoria para la zona andina colombiana; sin embargo, no ha sido un recurso genético prioritario de conservación. En el estudio se estableció una colección de trabajo registrada en una base de datos computarizada de 222 accesiones recolectadas en los departamentos de Nariño, Valle del Cauca, Cauca, Caldas, Quindío y Cundinamarca que representan la variabilidad existente de cultivariedades nativas y espontáneas. Las semillas del material recolectado se encuentran en el cuarto frío del Centro Experimental de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira. Esta colección contribuye a la conservación y al estudio de la diversidad de esta especie y a la disponibilidad de una base genética para futuros programas...

URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122008000200003

Palavras-chave: Physalis peruviana; Solanaceae; Diversidad genética; Banco de germoplasma.

Ano: 2008

Caracterización molecular de introducciones colombianas de zapallo Cucurbita moschata

Restrepo S,Javier A.; Vallejo C,Franco A.

Se realizó la caracterización molecular mediante el polimorfismo en la longitud de fragmentos amplificados (AFLP) de 121 introducciones de C. moschata, del Banco de Germoplasma del Programa de Investigación en Hortalizas de la Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira, provenientes de ocho departamentos de Colombia. Los datos AFLP se evaluaron utilizando análisis de correspondencia múltiple (ACM), distancia genética, análisis genético con el programa TFPGA y el método de agrupamiento UPGMA. La diversidad genética de estas introducciones fue alta y estuvo de acuerdo con la diversidad morfoagronómica estudiada previamente. Los valores Fst indicaron que existe estructura genética entre la mayoría de las introducciones. La mayoría de la variación genética...

URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122008000100002

Palavras-chave: Ahuyama; Cucurbita moschata; Diversidad genética; Estructura genética; Marcadores moleculares AFLP.

Ano: 2008

Caracterización morfológica de accesiones silvestres de guayaba

Jiménez Lozano,Liliana; Almanza Pinzón,Martha Isabel; Muñoz Flórez,Jaime Eduardo.

Se realizó la caracterización morfológica de 22 accesiones silvestres de guayaba Psidium guajava L. 14 colectadas en el municipio de Restrepo (Valle del Cauca), seis en Armenia (Quindío) y dos en Pereira (Risaralda). Se utilizaron 12 descriptores cuantitativos y 10 cualitativos de tallo, hojas y frutos; el análisis de agrupamiento se hizo mediante el coeficiente de Dice-Nei-Li y el promedio aritmético no ponderado (UPGMA). La mayor variabilidad se halló en los descriptores peso de la pulpa (CV = 55.92%), peso (CV = 45.23%), y acidez del fruto (CV = 44.75%). El análisis de agrupamientos con base en caracteres cuantitativos permitió establecer cuatro grupos: las accesiones del grupo A (Armenia), presentaron valores promedio de los descriptores de la calidad...